1994年，年仅8岁的卓文萱便已展露出对歌唱的浓厚兴趣，开始积极参与各类歌唱比赛，积累了宝贵的舞台经验。卓文萱写真1998年，当时正就读于台北市立福和国民中学的卓文萱，在一次校外举办的歌唱模仿组比赛中，选择了模仿知名歌手李玟的曲目。她的表演生动传神，赢得了现场观众的认可。演出刚刚结束，卓文萱的才华便被经纪人纪宏仁慧眼识中，随即与她签约，使其正式进入滚石唱片公司旗下，并由此开始了系统而专业的歌唱训练。到了1999年，仍在初中二年级就读的卓文萱，利用暑假时间首次远赴泰国录音室进行工作，在此期间，她为中国娃娃组合的成员贝儿提供了幕后代唱服务，这进一步锻炼了她的演唱技巧与录音室适应能力。
二零零一年，卓文萱正式开启了她的演艺生涯，推出了个人首张音乐专辑《1986》。次年，她将事业版图拓展至影视领域，出演了个人首部电视剧作品《水晶情人》。到了二零零六年八月二十日，由她主演的青春偶像剧《恋爱女王》与观众见面，她在剧中生动诠释了花式滑冰选手于巧乐这一角色；同年十一月十二日，她与杜德伟联袂主演的都市爱情剧《爱情经纪约》于台视播出，卓文萱在剧中扮演了宣梦跳的同学朱可欣；十二月，她乘胜追击，推出了个人第二张专辑《习惯》，这张专辑中的歌曲《对你的爱》由她亲自填词，歌词内容表达了对前男友的深切怀念；也是在这一年，她的音乐才华获得了认可，荣获了年度金曲金榜年度生力军奖。 二零零七年，卓文萱在创作上更进一步，推出了个人首部文字作品《GENIE 卓文萱 1986の独立萱言》；三月十五日，她与黄鸿升合作演唱了歌曲《爱的主旋律》；八月十七日，她与王少伟、曾之乔共同出演的言情剧《恶女阿楚》播出，她在剧中饰演了能歌善演的艺人汪芷儿；此外，同年她还参演了校园青春偶像剧《18禁不禁》，成功塑造了才貌双全的音乐才女朱亦瑄的形象。 二零零八年五月四日，她与汪东城、唐禹哲、小薰合作主演的青春偶像剧《翻滚吧！蛋炒饭》播出，她饰演了一位虽双目失明却依然乐观坚强的少女关小舒；八月二日，其出演的青春爱情偶像剧《公主小妹》登陆湖南卫视，她在剧中化身为宫氏集团的千金小姐宫茉莉；十一月七日，她的个人第四张音乐专辑《超级喜欢》面世；十二月五日，她成功举办了个人演唱会“爱的城堡 Love Music”。二零零九年七月五日，她发行了个人写真集《COSMOS TOUCH GENIE CHUO贴近卓文萱》，由此成为台湾首位发行写真卡的女艺人；十一月六日，第五张个人专辑《Play n Fun 1+1》正式发行；十二月，她再度举办“Genie Play Music 1+1”演唱会；同年，她还收获了新城劲爆新登场海外歌手奖的荣誉。 二零一零年一月二十七日，她与立威廉搭档主演的偶像剧《蓝海一加一》播出，她饰演了在男人堆中长大的女孩何真爱；七月二十二日，她为舞台剧《夏雪》演唱的同名主题曲《夏雪》正式上线；八月，她在新城国语力颁奖礼上获得新城国语力跃进歌手奖；十一月，她参与了“快乐天堂 滚石30演唱会”；同年，她还主演了音乐短片《他来听我的演唱会》。 二零一一年八月十六日，她主演的偶像剧《男女生了没》在中国台湾播出，她所饰演的黑又男性格率真、略带迷糊傻气，行为举止有些缺乏传统女人味；九月十六日，其出演的军事题材剧《勇士们》于台视播出，她在剧中扮演了一心为国除奸的热血青年徐玉树；十月十四日，专辑《反正卓文萱》发行，这张专辑展现了卓文萱从小女孩到轻熟女的风格转变，她也凭借此专辑获得了MusicRadio中国TOP排行榜颁奖晚会港台地区推荐唱片奖；十一月四日，她推出了歌曲《反派》，该曲大胆尝试了摇滚电子曲风；十二月三十一日，她亮相江苏卫视跨年演唱会，并与曹格共同演唱了歌曲《梁山伯与茱丽叶》。 二零一二年二月二十八日，她举办了“反正卓文萱”演唱会；三月，她与孙艺洲、王传君、赵霁合作主演了偶像剧《爱情是从告白开始的》，在剧中饰演了为爱勇往直前的女孩池早早；七月二十九日，她推出了与黄鸿升合唱的情歌《心爱的》，这首歌曲也被选为电视剧《就是要你爱上我》的片头主题曲。 二零一三年十一月二十九日，她与霍诗丹、张雁名、巫迪文等人共同出演的青春励志片《幸福快递》上映，她在片中饰演了不幸罹患白血病的台湾女孩以容。 二零一四年二月十四日，她参与录制的“越欢聚，越青春”快乐中国湖南卫视元宵喜乐会在湖南卫视播出，在节目中她与曹格合作演唱了歌曲串烧《起床歌》《梁山伯与朱丽叶》；八月二十二日，她与黑泽良平搭档主演的校园迷你剧《麻辣教师GTO台湾篇》在八大综合台播出，她在剧中饰演高校老师雪莉；九月二十六日，她的个人专辑《灼乐感》推出，凭借此专辑她获得了新城国语力女歌手歌曲奖，其中歌曲《心爱的》还荣获了音乐先锋榜最受欢迎先锋对唱金曲奖；十二月二十七日，她在广州成功举行了“一匹黑马”个人演唱会。 二零一五年五月，她参与了舞台剧《情人眼里出西施》的演出。 二零一八年三月，她出演了歌舞剧《赛貂蝉》；十二月十一日，她主演的青春校园片《兵荒马乱的爱情》在爱奇艺独家上线，她在片中饰演拳击系女生莫乱，并凭借这一角色获得了第四届金网电影盛典最佳女主角奖。 二零一九年九月，她拓展了事业领域，开始主持三立都会台的烹饪节目《型男大主厨》。
二零一三年七月十一日，卓文萱现身于第十三届中国（深圳）国际品牌服装服饰交易会现场。在此次活动中，她所主理的Adore.I.G.I品牌携手四家知名潮流品牌——包括黑人陈建州创办的“热血”、廖人帅主导的“OUTERSPACE”、辰亦儒旗下的“wow”以及浪花兄弟成员Darren创立的“Continued”——共同合作，联名推出了名为“大五限联名”的特别系列作品。随后在同年七月三十日，卓文萱正式宣布创立个人自主品牌“Adore.I.G.I”。进入八月，该品牌率先在台湾地区上市发行。在整个品牌创立与运营过程中，卓文萱深入参与了从行政管理、图案创意设计到面料材质挑选等各个环节，亲自把控每一个细节，展现出对品牌全方位的投入与主导。
歌手兼演员卓文萱在其个人著作《GENIE 卓文萱 1986の独立萱言》中曾提及自己的感情经历。她回忆道，早在2005年，当时年仅十九岁的她便与年长自己十四岁的吉他手杨声铮展开了一段恋情，但这段关系最终以分手告终。多年之后，在2021年3月20日于北京举行的个人演唱会期间，卓文萱接受了某家媒体的深度专访。访谈中，她公开承认了与比自己年轻六岁的男演员许少瑜正在交往的事实，并进一步透露两人已经稳定相处超过一年，感情状况十分融洽。此次坦诚分享也让公众对她当下的生活与情感状态有了更多了解。
二零零八年十一月九日，卓文萱以雨天街头募款代言人及红心字会公益大使的身份，亲自走上街头为弱势儿童募集善款；同年十二月十三日，她参与了由肯爱协会主办的“第三届拥抱爱：忘忧880 用爱抱抱您”公益活动，并担任台北地区关怀忧郁症患者的形象代言人，借此机会向社会大众发出呼吁，希望更多人能关注并理解忧郁症患者的处境。进入二零零九年六月九日，她受邀担任《让爱转动整个宇宙》的群星代言人，为此特别录制了一首公益歌曲《让爱转动整个宇宙》，这首歌不仅是为了纪念台湾九·二一地震中受灾的民众，更是为了见证灾难过后台湾人民所展现出的坚韧不屈的生命力量。二零一零年一月，卓文萱专程前往红心字会老人服务中心探望失智长者，并在现场举办的庆生会上，将自己专辑销售所得中的六十万元新台币全额捐赠给需要帮助的弱势家庭；同年三月，她与餐饮品牌合作开展公益项目，共同为贫困儿童筹集营养餐费，确保孩子们能获得基本的饮食保障。二零一二年十一月二十日，她出席某品牌与台湾世界展望会联合举办的“用最浓的爱 拥抱全世界”爱心募集成果记者会，现场捐出十顶附有个人亲笔签名的“Genie变身潮流帽”用于义卖，希望通过此类爱心义卖活动，进一步倡导社会公益理念，推动更多人参与慈善行动。二零一三年，卓文萱更远赴越南举办名为“爱在越南 甜心卓文萱”的公益演唱会，为越南故乡人道孤儿院募集社会资源，以实际行动关怀当地生活困苦的弱势儿童群体。
卓文萱是一位在事业与情感上都极为专注和投入的女性，她对待工作的勤勉与对待关系的真挚同样令人印象深刻，然而这份全情投入也让她有时更容易感受到外界的压力与伤害。从星座特质来看，她堪称摩羯座的典范，那些属于摩羯座女孩的典型性格在她身上得到了清晰而完整的体现。她不仅拥有内在的坚韧与勇气，更具备一种沉稳淡定的心境，言谈之间逻辑清晰、细致入微。当她以简洁利落的装扮搭配上一头垂顺的长发时，往往流露出一种含蓄而典雅的韵味，这种略带传统感的矜持气质，确实赢得了不少男性的欣赏与好感。无论是在日常生活里，还是在演唱会或各类公开通告中，她始终保持着独特的审美眼光，穿搭风格简约却绝不庸俗，再加上她天生开朗、充满朝气的个性，使她仿佛一个灵动活泼、备受众人喜爱的小精灵。值得一提的是，在某次演唱会现场，她曾身穿一袭白色裙装登场，袖口处点缀着蓬松的泡泡袖设计，领口则装饰有精致的玫瑰图案，这身造型既衬托出她甜美可爱的一面，又彰显出鲜明的个人风格，令人过目难忘。