一九五五年三月十七日，吴奇院士出生于安徽省芜湖市。幼年时期，他曾就读于当时位于芜湖市青山街（现为育红）的幼儿园。一九六一年，吴奇进入芜湖市第一中心小学学习，并有幸被编入市里推行六年制改为五年制的教学改革试点班级。一九六八年，他升入东方红中学继续学业。一九七零年春季，随着学校教育的恢复，吴奇转入芜湖一中学习。一九七三年，他被分配至芜湖市教育局临时协助工作，承担一些基础的行政事务。一九七四年初，吴奇被分派到芜湖二十中，担任化学教师，同时协助团委书记开展共青团的相关工作。一九七七年十二月十日，他参加了恢复后的首届高考。一九八二年，吴奇毕业于中国科学技术大学近代化学系化学物理专业。同年二月，他远赴美国纽约州立大学石溪分校深造，师从朱鹏年教授。一九八七年九月，吴奇获得美国纽约州立大学石溪分校哲学博士学位，随后继续留校，在化学系担任博士后研究员直至一九八九年五月。一九八九年到一九九二年期间，他任职于德国巴斯夫公司：起初作为洪堡基金会研究员，在Dieter Horn博士的指导下与Wolfgang Schrof博士开展为期一年的合作；之后获得公司永久聘用，担任固体和高分子物理部、分散体系组激光光散射实验室的主管。一九九二年，吴奇辞去在德国巴斯夫公司的永久职位，前往香港中文大学任教，担任英制讲师（Lecturer）。一九九五年，他受聘兼任中国科学技术大学化学物理系教授。一九九六年至一九九九年，他出任香港中文大学教授。同年，他还获得了国家杰出青年科学基金的资助。自一九九九年起，吴奇担任香港中文大学化学讲座教授。二零零零年，他获任为香港中文大学伟伦化学讲座教授。二零零三年，他当选为中国科学院院士。二零零四年，他担任合肥微尺度物质科学国家实验室低维物理与化学研究部主任。二零零五年一月起，他受聘担任中国科学技术大学化学学院院长。在学术活动方面，吴奇院士也曾参与多项重要学术交流，例如在报告会现场，林国强主任曾向吴奇院士颁发上海有机所交叉学科讲座证书，上海有机所也举行了交叉学科讲座授牌仪式。吴奇教授在讲座中畅谈了科研精神与心得体会，其演讲主题涵盖“从基础研究谈起”以及“食品科学与加工”研究等多个领域，相关报告活动也留下了“吴奇作报告”等记录。二零二四年十一月，吴奇院士被聘为仲恺农业工程学院高质量发展战略咨询委员会委员。
吴奇通过实验测定了聚四氟乙烯的分子量分布及其链构象特征，并观察到高分子线性长链的形态能够依据溶剂性质的不同而发生显著变化。该变化具体表现为分子链从原本伸展的无规线团状态逐渐蜷缩，最终形成结构稳定的单链小球，这一过程清晰地揭示出链折叠并非一种“全有或全无”的简单转变，其间实际存在着一个过渡性的“融化球”状态。基于这些发现，吴奇对高分子链在组装形成聚集体过程中的稳定机理提出了若干具有独创性的见解。在1996年，凭借国家自然科学基金委杰出青年基金的资助，吴奇于中国科学技术大学成功创建了大分子胶体与溶液实验室，并以此为基础系统性地展开了大分子物理及胶体化学相关领域的深入研究。截至2017年10月30日，吴奇已在包括JACS、Accounts of Chemical Research、Advances in Polymer Science以及Physical Review Letters在内的众多国际知名学术刊物上累计发表论文超过260篇，其中仅发表在Macromolecules期刊上的论文就达94篇。同样截至该日期，吴奇已成功获得三项发明专利授权，并完成了两项技术的实际转化应用。此外，在学术交流方面，截至2017年10月30日，吴奇曾六十五次受邀在国际学术会议上作邀请报告，其中包括两次在美国举办的“Gordon”学术会议以及一次美国物理年会，这些报告充分体现了其研究成果在国际学术界所受到的广泛关注与认可。
截至2017年10月30日，吴奇教授在中国科学技术大学的人才培养方面已取得了显著成果，累计成功培养了3名博士研究生，同时还有6名博士生正在其指导下进行学习与研究。在其培养的学生中，已有2名博士生凭借出色的学术表现先后荣获“求是”优秀研究生奖。特别值得一提的是，吴奇教授指导的首位博士生于2001年顺利毕业，其撰写的博士论文因学术价值突出，荣获当年中国科学院院长特别奖，这充分体现了吴奇教授在学术指导上的深厚功底。在学术交流与分享方面，吴奇教授也积极参与各类活动，例如在2007年4月4日，他应邀在中国科学技术大学理化大楼西三楼学术报告厅进行了一场题为“科大和我”的专题报告，与师生分享了自己的学术经历与感悟。此后，在2019年7月9日，吴奇教授又受邀前往东南大学进行讲学，围绕“从‘何为基础研究’谈起”这一主题开展了深入的讲座，引发了在场师生的广泛思考。同年12月27日下午，吴奇教授再次应邀出席中国科学院上海有机化学研究所举办的“黄耀曾科学与人文讲座”，并以“从‘何为基础研究？’谈起……”为题作了内容丰富、见解独到的学术报告，进一步促进了相关领域的学术对话与思想交流。
一九八四年年底，吴奇的妻子——她曾是吴奇在芜湖师范学校读书时的同学——前往美国石溪大学进行学术访问与学习。至一九八六年年初，他们的儿子在石溪出生；随后在一九八七年年底，女儿洋石也来到了这个世界。在此期间，吴奇的妻子通过自身努力，先后取得了英语外教专业的硕士学位以及语言学的博士学位，在学术道路上取得了显著成就。回顾吴奇的早年教育经历，他小学时就读的是当时芜湖地区仅有的两个试点班之一，这些班级使用的教材专门从北京调运而来，而担任数学与语文教学工作的老师均为经过严格评定的特级小学教师，教学资源可谓十分优越。进入中学阶段后，吴奇的化学与语文教师来自合肥师范学院，是具备大学授课经验的教师；数学老师则是安徽师范学院一位资历深厚的老讲师，师资配置同样相当突出。一九七二年，吴奇正式高中毕业，恰逢邓小平同志重新主持工作、教育领域逐步恢复秩序的时期。由于当时安徽省中学师资力量严重不足，教育部门决定从文革后首届高中毕业生中选拔一批人担任民办教师。在芜湖地区，相关部门从约三千六百名学生中遴选出约一百二十人，吴奇便是其中之一。这批通过考核录取的学员随后被集中至师范学校，接受了为期半年多的强化培训。吴奇当时被编入数理班进行专业学习，结业后被分配至中学担任初三化学教师，由此开始了他的教育职业生涯。
吴奇教授被公认为全球范围内最具权威性的激光光散射专家之一，其领导的实验室凭借在高分子溶液特性、凝（冻）胶网络结构、纳米粒子制备以及分子自组装机制等前沿领域的卓越研究而享有盛誉。作为激光光散射技术应用与发展的重要推动者，吴奇教授尤其善于运用化学研究方法与工具，来深入剖析和解决复杂的物理学问题。他在高分子科学领域贡献卓著，特别是在揭示高分子溶液中分子链的精细构象、动态行为规律以及相转变过程等方面，开展了系统而深入的研究工作，为相关理论体系的完善与实际应用的拓展奠定了重要基础。