出生于1970年的瞿友宁，自小学一年级起便时常获得免费的电影招待票，并由此养成了观影的爱好。由于当时电影院实行不清场制度，他常常从中午入场，一直沉浸在光影世界中，直到晚上九点才离开。早在高中阶段，瞿友宁内心就已萌生了对电影导演职业的深切向往，然而母亲更希望他攻读前景更为稳妥的商业或法律专业。经历两次高考后，他最终考入世新大学电影系，正式踏上了电影学习之路。在世新求学期间，一次打工的机会让他有幸结识了著名导演杨德昌，从专科二年级开始，瞿友宁便跟随杨德昌参与电影拍摄实践《牯岭街少年杀人事件》。不过，由于当时对电影行业的实际环境尚不熟悉，拍摄过程中遇到的许多情况都超出了他的预想，因此在跟随学习一段时间后，他选择了暂时离开。瞿友宁自幼在写作方面展现出过人天赋，作文屡屡获奖，初中老师曾评价他拥有超越年龄的文字表达能力。就读大专时，他甚至利用课余时间在补习班教授作文课程。基于这些经历与特长，他决定从编剧岗位起步，遵循“编而优则导”的职业路径，期盼能更快地坐上导演的位置。为此，他持续通过参加各类剧本与创作比赛来寻找机会，几乎逢赛必投，并凭借出众的才华赢得了不少奖项与奖金，这些积累不仅为他提供了经济支持，也一步步推动着他向着心中的导演梦想扎实迈进。
一九九二年，瞿友宁凭借其个人创作的首部剧本《街头石子》荣获优良电影剧本奖；此次获奖迅速引起了知名导演王小棣的关注，并因此受邀进入民心工作室（即后来的稻田工作室）从事剧本创作，期间他曾参与编写《母鸡带小鸭》以及若干半小时时长的单元剧作品。一九九三年，他再次以剧本《游在窗上的一朵海洋》夺得优良电影剧本奖。一九九五年，瞿友宁凭借《从七点到七点》第三次收获优良电影剧本奖的肯定；同一年，他执导了十六厘米规格的剧情片《街头石子》，该片探讨了人与人之间即便素不相识，也可能在无知的互动中彼此造成伤害的主题。一九九七年，他执导了个人首部三十五厘米剧情片《假面超人》，其剧本正是一九九五年的获奖作品《从七点到七点》，影片讲述了三对感情出现问题的情侣，在一个难以入眠的夜晚意外卷入一桩谋杀案的故事，然而该片票房表现极为低迷，仅为四万九千多元新台币，成为当年票房最低的电影，这也使得瞿友宁背负了超过六百万元新台币的债务；为了偿还债务，他在随后的五、六年时间里接拍了大量纪录片与专题报道片。一九九九年，他拍摄了一部关注罕见病儿童的纪录片《星星的秘密》，这部作品成为他逐渐走出此前失败阴影的重要转折点。二零零零年，瞿友宁执导了情感剧《谁在桥上写字》，该剧讲述了花莲县光复乡一个阿美族村落中，村民们内心长久以来所怀抱的一个美丽神话传说，此剧获得了第三十五届台湾电视金钟奖七项提名，而瞿友宁本人则成功斩获了戏剧节目最佳导演、最佳编剧以及单元剧奖三项大奖。二零零二年，他创立了氧气电影公司。二零零三年，他执导了都市爱情剧《蔷薇之恋》，剧情围绕一个长期被他人轻视的平凡女孩展开，描绘她在经历重重人生考验后绽放光彩的历程，该剧还赢得了第三十九届台湾电视金钟奖年度最受欢迎戏剧节目奖。二零零四年，瞿友宁凭借剧本《英勇战士俏姑娘》第四次获得优良电影剧本奖；同年，他执导了情感剧《绝地花园》之《爱情故事》，该剧由八位导演共同参与，分别讲述了八位坚韧面对生命的罕见疾病病友的故事。二零零五年，他执导了爱情轻喜剧《恶作剧之吻》，该剧改编自日本漫画家多田薰的漫画作品《淘气小亲亲》，讲述了天真迷糊的少女袁湘琴与天才美少年江直树之间一段温暖动人的爱情故事，此剧成为当年度的收视冠军。二零零六年，瞿友宁执导了以美食为题材的爱情剧《美味关系》，该剧改编自日本漫画家槇村怜的同名漫画。二零零七年，他执导了爱情轻喜剧《恶作剧2吻》。二零零八年，他再次执导爱情轻喜剧《王子遇见二公主》，该剧讲述了一位服饰公司小开与一位极具天赋的服装设计女孩之间诙谐有趣的爱情经历。二零零九年，他执导了情感剧《桃花小妹》，此剧改编自日本漫画《桃花妹妹》，讲述了拥有四位哥哥的女主角桃花，在恋爱过程中不断受到妹控兄长们种种阻挠的温馨故事。二零一零年，他执导了情感剧《我的爸爸是流氓》，瞿友宁凭借此剧获得了第四十五届台湾电视金钟奖迷你剧集导演奖。二零一一年，他执导了都市情感剧《我可能不会爱你》，该剧讲述了优秀而骄傲的女主角程又青在经历了几段不尽如人意的感情后，最终发现那个对的人一直默默守候在身边的故事，此剧获得了第四十七届台湾电视金钟奖八项提名，并一举囊括七个奖项，成为金钟奖历史上获奖最多的戏剧作品，瞿友宁也再次夺得导演奖和戏剧节目奖。二零一二年，瞿友宁自编自导了都市情感剧《小时代之折纸时代》，该剧改编自郭敬明的小说《小时代1.0》。二零一三年，他自编自导了剧情片《亲爱的奶奶》，这部影片源于瞿友宁的亲身经历，表达了他对祖母的深切思念与那些难以磨灭的记忆片段，同时深入探讨了家庭成员之间的亲情矛盾与内心挣扎，该片获得了第五十届台湾电影金马奖最佳原著剧本提名，这也是他首次获得金马奖提名；同年，他还担任了第四十八届台湾电视金钟奖评审团的委员。二零一四年，瞿友宁出任优良电影剧本奖的评选委员；同年，他执导了都市情感剧《你照亮我星球》，该剧以演艺圈的黑暗面为主题，描绘了两位小明星历经艰辛最终跻身一线行列的奋斗历程。二零一五年，他担任了“第一届厦门国际青年微电影节”评审团委员；同年，他执导了社会写实剧《哇！陈怡君》，该剧讲述了三位年轻人共同面对社会挑战与试炼，在一片质疑声中成功打赢一场属于年轻人胜仗的故事。二零一六年，他再度担任优良电影剧本奖的评选委员。二零一七年，他出任“第三届厦门国际青年微电影节”评审团委员；同年，担任第五十二届台湾电视金钟奖评审团迷你戏剧召集人；也是在这一年，他执导了家庭奇幻喜剧《花甲男孩转大人》，故事以台湾乡下望族郑家的长孙郑花甲的自我成长为主线，交织家族成员间争夺祖产最终尽释前嫌的过程，该剧获得第五十三届台湾电视金钟奖十一项提名，瞿友宁也再次赢得了金钟奖戏剧节目奖。二零一八年，由瞿友宁执导的喜剧电影《花甲大人转男孩》上映，该片改编自剧版《花甲男孩转大人》，上映三十一天后票房突破新台币一亿元；三月二十九日，他执导的都市爱情网络剧《动物系恋人啊》在搜狐视频独家首播，该剧根据花花酱的同名小说改编，讲述了乖乖女楚之河在与稳重的王大树相爱的过程中获得自我成长的故事；同年，瞿友宁与王小棣、蔡明亮等共八位金马奖与金钟奖导演合作成立并开设了深度表演课程（StudioQ 表演教室），同时致力于电影与电视剧的制片拍摄工作。二零一九年，瞿友宁担任了第五十四届台湾电视金钟奖评审团的主任委员，同时还出任了第五十六届台湾电影金马奖评审团的委员。二零二零年，他担任了剧情片《刻在你心底的名字》的编剧及监制；同年，再度担任第五十五届台湾电视金钟奖评审团主任委员。二零二四年十月十三日，他参与的综艺节目《芒果新生班》正式播出。二零二五年二月十八日，由他执导的电视剧《难哄》也与观众见面。
瞿友宁年仅一岁时，他的父亲便因突发意外不幸离世，此后他主要由奶奶和母亲共同抚养长大。奶奶长期在菸酒公卖局任职，而母亲最初曾在歌厅工作，自丈夫去世后便转入工厂，以稳定的收入支撑家庭。在瞿友宁的成长历程中，与他互动最为密切、影响最为深刻的往往是身边的女性长辈，这种由祖母与母亲共同构筑的成长环境，使他对女性群体怀有深厚的尊敬与天然的好感，这也反映在他日后创作的许多戏剧作品里——女性角色常常被赋予丰富的情感层次和重要的叙事分量。2007年，瞿友宁与一位比他年轻九岁、并非演艺圈内人的女友步入婚姻，同期他正忙于执导电视剧《美味关系》的拍摄工作。婚后，导演事业的繁忙程度并未减轻，在家庭与工作之间寻求平衡变得格外艰难；由于长期投身于剧组事务，又不愿让妻子时常面对自己忙碌疲惫的状态，这段婚姻在维持五年后最终画上句点。离婚之后，瞿友宁也曾展开新的恋情，有一任女友家中遭遇丧事，即使他工作安排再紧凑，仍坚持抽身前往对方家中帮忙打理事务，并尽可能挤出时间陪伴情绪低落的女友，然而这段关系并未长久，他后来发现女友竟与殡仪馆馆长发生了感情背叛。在职业生涯中屡获殊荣、得到多项奖项肯定的瞿友宁，并未止步于导演与编剧的身份，他还拓展了教学方面的角色，以讲师的身份重返母校世新大学，将自己的实务经验与创作理念传递给新一代的学生。
在备受瞩目的都市情感剧《我可能不会爱你》中，女主角林依晨成功实现了荧幕形象的华丽转型，她彻底摆脱了早年作品中那种稚气未脱、天真呆萌的袁湘琴形象（这一经典角色源自《恶作剧之吻》），转而塑造了一位成熟干练、富有主见的现代都会女性程又青。与此同时，男主角陈柏霖凭借其出色的演绎，完美化身成为无数观众心目中近乎完美的理想情人形象。导演瞿友宁通过这部作品，再次引领了偶像剧创作的风潮，他不仅成功突破了此类题材的固有框架，更将剧集提升至一个新的艺术高度，使得智慧、独立且人格魅力十足的程又青这一形象深入人心，几乎让人们忘却了昔日的袁湘琴。整部作品细腻而深刻地探讨了“爱”的多重面貌与真实本质，让观众得以重新审视情感关系中的真诚与成长，瞿友宁也因此被广泛赞誉為一位深谙爱情哲学、作品充满人文温暖的杰出导演。 瞿友宁的创作才华并不仅限于都市爱情题材，在其另一部突破性的电视作品《花甲男孩转大人》中，他大胆跳脱了熟悉的都会爱情格局，转而将目光投向更广阔的叙事空间。该剧以全新的视角和手法，重新改写了传统“乡土剧”的定义，摒弃了此类剧集常有的浮夸情节和过度煽情的套路，转而以幽默诙谐的笔触、温暖治愈的基调以及真挚感人、催人泪下的故事内核，构建出一个充满烟火气息又触动心弦的世界，再一次牢牢抓住了广大观众的情感共鸣。瞿友宁的作品往往展现出一种超越性别的深刻洞察力，甚至比许多女性导演更为了解女性复杂而丰富的内心世界。在他所执导的戏剧中，女性角色从来都不是单薄的符号或陪衬，而是被塑造得血肉丰满、层次分明，洋溢着蓬勃的生命力与自主意识。与此同时，在这些以男性角色成长为主线的情节里，女性依然扮演着不可或缺的稳定力量与精神支撑，体现出两性之间相互成就的深刻关系。 瞿友宁天生具备一种敏感而细腻的艺术气质，这使他比寻常人更能体察与领悟女性身上所特有的那种坚韧不屈的韧性与宽广无私的包容力。他也是一位叙事高手，极其擅长运用通俗易懂、贴近生活的艺术手法，来讲述那些蕴藏在日常点滴之下的深层情感。其作品之所以能够如此透彻地穿透人心、引发广泛而强烈的共鸣，或许正是源于其中所流淌的那份与普通人生活紧密相连、丝丝入扣的质朴人情味，以及对于人性温暖与美好的执着追寻。
电视剧《亲爱的，热爱的》最初由来自台湾的导演瞿友宁担任执导工作，然而在该剧播出的第39集里，出现了一幅引起广泛关注的地图画面。这幅地图中将中国绝大部分版图标注为浅蓝色，但原本属于中国领土的海南岛和台湾岛却被单独涂成了深蓝色，这一细节迅速引发观众与舆论的强烈反应，许多人质疑导演瞿友宁是否具有台独倾向。随着争议不断发酵，剧方最终决定调整制作团队，后续的执导工作改由台湾导演李青蓉与大陆导演项旭晶共同接手。此外，在各主流视频平台播出的剧集内容也经过修改，对海南、台湾等地区的颜色标识进行了统一修正，确保其与中国其他领土的标示保持一致。面对外界的质疑，瞿友宁导演随后公开回应，表示自己从未在成片中注意到该地图的存在，并再次郑重声明他始终坚持一个中国的原则，期待两岸之间能够持续增进理解，以更加友善的方式进行交流与合作。