清原果耶自幼便展现出对表演艺术的浓厚兴趣，自小学一年级起她便开始接受系统的古典芭蕾训练，打下了坚实的舞蹈基础。进入小学五年级后，她的学习范围进一步拓宽，开始同时涉猎现代舞蹈、歌曲演唱、音乐剧表演以及芭蕾舞的深化学习，展现出全面的艺术天赋。2014年10月，时年12岁的清原果耶报名参加了由AMUSE事务所主办的大型新人发掘选秀活动“AMUSE audition festival 2014”。在这场竞争激烈的选拔中，她凭借出色的综合实力从总计三万两千两百一十四名参赛者中一路过关斩将，最终荣获最高奖项，由此正式开启了她的演艺生涯。
清原果耶的演艺事业于2015年正式拉开帷幕。在这一年年初，她凭借成为“三井不动产”与“安斯泰来制药”两个品牌广告的代言人，开始进入公众视野并获得了初步的关注。同年三月，她与时尚杂志《nicola》展开合作，从该杂志的四月号起正式成为其专属模特，开启了在时尚领域的探索。四月，她与演员野村周平合作，共同为剧场动画作品《台风的诺尔达》中的主要角色配音，这是她在声优领域的初次尝试。到了九月，她通过出演NHK晨间剧《阿浅来了》，在剧中饰演了女仆“阿冬”这一角色，从而以演员的身份正式出道，迈出了表演生涯中的重要一步。 进入2016年，清原果耶的演艺活动变得更加活跃。三月，她在由绫濑遥主演的NHK九十周年纪念作品、幻想题材大河剧《精灵守护者1》中，饰演了女主角“巴尔莎”的少女时期，展现了角色早期的形象。四月，她参演了由竹野内丰主演的奇幻类型日剧《了不起的选TAXI特别篇》，进一步拓宽了戏路。六月，她在TBS电视台的深夜剧《毒岛百合子的赤裸裸日记》中客串出演，实现了在民营电视台的首次亮相。七月，她在松井珠理奈主演的悬疑剧《死币》里，扮演了女主角“南由夏”的妹妹“南小梦”一角。此外，在同一年，她还参演了由福士苍汰主演的纯爱题材电影《明日的我与昨日的你约会》，并在片中饰演了女主角“福寿爱美”的中学时代，展现了角色青春期的面貌。 2017年对清原果耶而言是收获颇丰的一年。她在一场有五百人参与的公开募集甄选会中脱颖而出，成功赢得优胜，并因此获得了出演漫画改编电影《三月的狮子》的宝贵机会。同年四月，她确定加盟由吉高由里子主演的悬疑电影《摇曳不安的心》。此外，她还与广濑铃、野村周平、松冈茉优等多位知名演员合作，共同出演了另一部改编自漫画的校园题材电影《花牌情缘：结》，在片中饰演了与女主角“绫濑千早”互为竞争对手的角色“我妻伊织”。同年十月六日，她出演的电视剧《BORDER 冲动~检视官比嘉美香~》与观众见面。紧接着在十月十三日，她参与的另一部电视剧《濑户内海》也正式播出。 2018年，清原果耶继续在影视领域稳步前行。二月，她参演了由松本润主演的律政题材电视剧《99.9-刑事专业律师-第二季》。到了七月，她迎来了职业生涯中的一个重要里程碑，首次担任主演，出演了NHK的连续剧《透明的摇篮》，展现了其作为主演的潜力和魅力。
在2019年1月26日，清原果耶出演了电影《日与夜》，并在其中饰演了角色大野奈奈。此前一天，即1月25日，她参演的另一部电影《爱呗》也正式上映。同年7月26日，她主演的NHK连续剧《萤草》开始播出。而在7月6日，她参演的剧集《恶毒女儿・圣洁母亲》也已播出；到了10月，她出演的电视剧《我的事说来话长》也如期与观众见面。进入2020年，在黄金飞翔奖颁奖典礼上，清原果耶凭借出色的表现获得了最佳新人奖，并亲自出席了领奖仪式。同年，她还首次担任主演，出演了电影《宇宙中最明亮的屋顶》。2021年，她出演的电影《进入盛夏之门》上映，在片中她饰演了松下璃子一角。3月19日，她与成田凌共同主演的电影《不恰当的是与你一起》上映。4月9日，她参演的电影《破碎的瞬间》上映。5月17日，她主演的晨间小说连续剧《欢迎回来百音》开始播出。此外，她还参演了电影《致那些得不到保护的人》。在《致那些得不到保护的人》中，她饰演了圆山干子。2022年1月11日，她主演的电视剧《Fight song》播出，她在剧中饰演了一位一直致力于成为空手道国家队成员的木皿花枝。10月21日，她出演的电影《墨绘今生》上映。在《Fight song》中，她再次饰演了木皿花枝这一角色。2022年10月16日，她主演的电视剧《灵媒侦探城塚翡翠》播出。11月20日，她主演的另一部电视剧《城塚翡翠倒叙集》也相继播出。同年，她凭借在电影《那些得不到保护的人》中的精湛演技，成功获得了第76届日本每日电影奖最佳女配角奖以及第45届日本电影学院奖最佳女配角奖。在《灵媒侦探城塚翡翠》中，她饰演了城塚翡翠（右）一角。2023年7月7日，她与冈田将生共同主演的电影《消失的情人节》（日本翻拍版定名为《１秒先の彼》）正式上映。2024年3月14日，由清原果耶主演的《青春18×2 通往有你的旅程》在中国台湾率先上映，随后于5月3日在日本本土上映。5月19日，她主演的电影《错过你的那些年》在中国内地上映。10月20日，她出演的电视剧《我的日记》开播。2025年3月30日，她参演的电视剧《海星的Clutch日记》播出；同日，她参演的另一部电视剧《我的事说来话长～2025・春～》也同步播出。4月4日，她主演的电影《单恋世界》上映。7月，她主演的电视剧《初恋DOGs》播出。11月13日，她主演的网飞日剧《武士生死斗》正式播出。
清原果耶在艺术领域展现出多方面的才华，其中尤为突出的特长是歌唱与舞蹈。她特别擅长演绎音乐剧《安妮》中的经典曲目“Tomorrow”，并能通过自己的表演赋予这首歌曲独特的感染力与情感深度。在演艺生涯的道路上，她一直将堀北真希视为自己憧憬和学习的女演员榜样，同时，她也以同事务所的前辈吉高由里子作为明确的职业目标，希望自己能够成长为同样备受认可的优秀演员。此外，在时尚领域，清原果耶也十分欣赏模特rola的风格与表现力，并将其视为自己心目中理想的模特典范。
清原果耶凭借在晨间剧《阿浅来了》中成功塑造了女仆阿冬这一角色，其扎实细腻的演技赢得了观众与评论界的广泛赞誉。此前，她在AMUSE事务所主办的甄选会上，就以出色的表现力、出众的外形条件以及极高的可塑性脱颖而出，几乎获得了全体评委的一致认可并最终胜出，其甄选过程中的表现可谓十分亮眼。尽管年纪尚轻，清原果耶却展现出超越年龄的沉稳与强大的个人气场。随后，她在晨间剧《阿浅来了》中的表演更是格外闪耀，不仅显著提升了自身的行业存在感，也凭借其动人的演绎吸引了来自不同年龄层、不同性别的广大观众的深切关注。