一九八三年八月十五日，牟元笛诞生于吉林省吉林市的一个普通工人家庭，自幼便显露出对文学艺术的浓厚兴趣与天赋。一九九二年，当时正在吉林市昌邑区第二小学校就读二年级的牟元笛，恰逢市青少年宫京剧班的老师前来学校选拔学员，他凭借一段现代京剧《红灯记》中“都有一颗红亮的心”的精彩唱段脱颖而出，由此开始了课余时间学习京剧表演的艺术之路。他的启蒙行当是京剧花旦，首次登台演出的剧目为《红娘》中的“传柬”一折，并在次年以此剧目参加了吉林省“六一”儿童节晚会的演出，获得了初步的舞台经验。一九九三年，牟元笛成功考入吉林省戏曲学校九三级京剧班，正式专攻旦行，师从康慧兰、王继珠等老师，通过系统而严格的专业学习与训练，为其奠定了极为扎实的戏曲表演基本功。 一九九四年，牟元笛跟随吉林省代表队前往天津，参加了全国“新苗奖”第二届少儿京剧邀请赛，演出剧目《红娘》，并荣获业余少年组一等奖的佳绩。一九九七年，他又随吉林省戏曲学校赴南京，参与了中国戏剧家协会主办的全国少儿戏曲大赛暨首届中国少儿戏曲小梅花荟萃活动，演出《失子惊疯》，获得了专业组二等奖的肯定。二零零零年，牟元笛正式进入哈尔滨市京剧院工作，成为一名专业京剧演员。次年，他随剧院赴南京参加了第三届中国京剧艺术节。二零零二年，因表现突出，他荣获了哈尔滨市文化局颁发的优秀共青团员称号。 二零零四年，牟元笛考入了北京戏曲艺术职业学院戏曲系专科，有幸拜在尚（小云）派嫡传弟子李喜鸿老师门下深入学习。二零零五年暑假期间，他随学校赴上海、武汉、天津等地进行巡回演出，主演剧目《失子惊疯》，其扎实的基本功和精湛的水袖技巧赢得了业内外的广泛关注，开始崭露头角。同年，他还荣获了北京戏曲艺术职业学院二零零四至二零零五学年的“三好学生”称号，并开始向林燕老师请教学习。二零零六年一月，牟元笛赴上海参加天蟾逸夫舞台举办的“乾旦坤生女花脸”两场专场演出，分别主演了《红鬃烈马》（饰演代战公主）和《失子惊疯》，其表演再次引起了上海戏曲界的密切关注。同年七月，牟元笛专科毕业，随后进入升学备考阶段。十月，他受邀出访土库曼斯坦，在阿什哈巴德、巴尔坎纳巴德等地进行了巡回演出。十一月七日，在孙毓敏院长的举荐与安排下，牟元笛正式拜尚派名家孙明珠为师，艺术造诣得以进一步精进。 二零零七年三月，牟元笛考入中国戏曲学院继续教育系本科深造，戏剧戏曲导演课程师从杨非老师，剧目课受教于林萍、李树萍、张逸娟等老师，身段课则由王诗英老师亲自指导。同年十月，他以京剧《失子惊疯》参加了中国戏剧家协会主办的第三届“中国戏曲红梅荟萃”评选活动，凭借出色表现荣获了“中国戏曲红梅金花”的称号。二零零八年二月，牟元笛与杨磊、尹俊共同参与了北京电视台《百姓秀场》节目的录制。四月，他又赴福建电视台录制了《走南闯北》节目。同年，他被借调至上海戏剧学院附属戏曲学校，参与排演新编京剧《诸葛亮招亲》，并在剧中饰演女主角阿丑，该剧先后在上戏剧院和天蟾逸夫舞台公演了四场，获得了观众的好评。
二零零九年一月，牟元笛顺利完成本科学业，被授予文学学士学位。同年九月，他正式进入上海戏剧学院附属戏曲学校任职，担任京剧教研室教师，开启了其戏曲教育生涯。二零一零年一月，牟元笛专程赴北京参加了“纪念京剧大师尚小云先生诞辰110周年”的重要演出活动。三月六日，他在上海天蟾逸夫舞台亮相，参演了“乾旦坤生女花脸”专场演出。三月二十六日，他与胡文阁、杨磊、尹俊等艺术家一同登上北京长安大戏院的舞台，献艺于“梅尚程荀”四大流派男旦专场。同年五月，经由孙明珠老师引荐，牟元笛开始向著名京剧表演艺术家毕谷云先生潜心求教。六月，他与毕谷云老师合作，参与了日本NHK电视台一部纪录片的拍摄工作。七月二十一日，他再次现身天蟾逸夫舞台，参加“传统剧目抢救挖掘传承专场”演出。八月二十一日，他重返长安大戏院，参演了“梅尚程荀”四大流派男旦专场（第二季）。十月，他的艺术足迹首次延伸至海外，赴新加坡于滨海艺术中心登台献艺。十二月，他再度赴京，参加了“庆祝中国京剧入选世界非物质文化遗产名录”主题晚会。 二零一一年一月十一日，牟元笛于长安大戏院参演了“梅尚程荀”四大流派男旦专场（第三季）。五月，他在天蟾逸夫舞台参加了“梅尚程荀”四大流派男旦折子戏专场演出。七月，他参加了首届中国京剧艺术基金会京剧教师进修班，师从谢锐青老师深造。十月，他为庆祝长安大戏院重张15周年，参与了庆典演出“梅尚程荀”四大流派男旦专场。二零一二年三月二十五日，在上海天蟾逸夫舞台，牟元笛公演了《虞小翠》（选场）以及全本《后部玉堂春》。四月，他与毕谷云老师共同参与了中央电视台大型纪录片《京剧》的拍摄。六月，师徒二人接受了《生活周刊》的连载专访。十月，他随学校赴香港，参加了“庆祝中国京剧艺术基金会成立20周年汇报演出”。十二月十六日，他在天蟾逸夫舞台首次公演了全本《绿珠坠楼》。 二零一三年七月，牟元笛指导歌手张韶涵进行戏曲表演，节目于江苏卫视《全能星战》中播出；同月，他参加了第二届中国京剧艺术基金会京剧教师进修班，向李玉芙老师学习。九月，他参与了上海电视台百集微纪录片《上海100》中《戏·梦》的拍摄。十月，他为黑龙江卫视《挑战名人墙》录制了节目。十二月，他赴宁波出席中国戏曲表演学会2013年年会暨戏曲表演研讨会，并在相关晚会中演出。 二零一四年二月，牟元笛随学校赴美国，在亚特兰大、华盛顿、纽约等地进行了巡回演出。二月二十八日，他在天蟾逸夫舞台与王立军等艺术家合作，演出了全本《翠屏山》。三月至四月间，他受邀独自前往美国洛杉矶，在美国加州州立大学北岭分校举办了戏曲表演工作坊及“中国京剧音乐艺术”讲座，并在洛杉矶汉默博物馆首演了其个人作品《我是男旦》。五月，他参加长安大戏院“五·四青年节”全国优秀青年京剧演员演唱会，与尹俊合演了《失子惊疯》。八月，他参加了第三届中国京剧艺术基金会京剧教师进修班，师从王诗英老师。十月，其作品《我是男旦》成功入选上海国际艺术节扶持青年艺术家计划，并进行了邀约作品展演。 二零一五年一月，牟元笛赴陕西卫视录制了《超级老师》。二月，他与胡文阁、杨磊、尹俊一同赴湖南卫视，录制了2015全球华侨华人春节大联欢晚会。三月，他再赴陕西卫视录制《超级老师》，并荣获“超级老师”荣誉称号。四月，他随学校赴丹麦进行文化交流，编演了戏曲舞蹈《卧虎藏龙》。五月，他携学生李宣赴河南卫视录制了《梨园春》。七月，他与胡文阁、杨磊、尹俊赴天津卫视录制《群英会》；同月，他参加了第四届中国京剧艺术基金会京剧教师进修班，继续向王诗英老师学习。九月，他参与了央视大型纪录片《百年巨匠·京剧篇之四大名旦》的拍摄。十月至十一月，他随学校出访克罗地亚首都萨格勒布以及罗马尼亚的德瓦、锡比乌、布拉索夫、布加勒斯特等地进行巡演。十二月九日，他在天蟾逸夫舞台公演了“纪念京剧大师尚小云诞辰115周年——牟元笛传承尚派经典剧目专场”。 二零一六年一月十七日，牟元笛赴京参加梅兰芳大剧院“四大流派乾旦专场演出”。三月，他随学校赴香港中文大学举办艺术讲座。三月二十六日，他在周信芳戏剧空间举办了“淮秀争妍——牟元笛戏曲教学淮剧专场”演出。四月至五月，他赴新加坡中国文化中心及马来西亚吉隆坡演出《我是男旦》。七月至八月，他赴北京参与拍摄由张艺兴主演的故事影片《老九门番外之二月花开》，在片中饰演白湛梅一角；同月，他为网剧《灵魂摆渡》配唱了昆曲选段。九月二十九日，他在端钧剧场与王立军合演了全本《战宛城》。十月，他随学校赴香港演出“姹紫嫣红·2016中国传统戏曲曲艺推广巡演”。十月二十二日，他录制了山东卫视《我是先生》。十二月二十四日，他在天蟾逸夫舞台公演了全本《虹霓关》。十二月三十一日，他在北京中华世纪坛首演剧场，参加了中华世纪坛传统文化季“非遗背后的故事——京剧四大名旦赏析汇”的演出。 二零一七年一月二十二日，牟元笛赴京与胡文阁、杨磊、尹俊共同参加梅兰芳大剧院“四大流派乾旦专场演出”。五月，他荣获第十三届全国中等职业学校“文明风采”竞赛活动决赛优秀指导教师奖。六月十一日，他在天蟾逸夫舞台再度公演了全本《绿珠坠楼》。七月十七日，他在同一舞台与严庆谷合演了《打杠子》。八月，他参加了第六届中国京剧艺术基金会京剧教师进修班，再次向李玉芙老师学习。十月，他赴香港文化中心参加“京昆粤·南北和·庆回归大汇演”系列演出。十二月一日，他在天蟾逸夫舞台首次公演了全本《天女散花》。十二月六日，他赴澳大利亚悉尼，先后在悉尼中国文化中心演出《我是男旦》、参与澳洲国家电台直播节目“文化苦丁茶”栏目访谈、并在2017悉尼华商“商赢合作发展论坛”上进行演出。十二月二十二日，他赴安庆出席中国戏曲表演学会第四届代表大会并参加了晚会演出。 二零一八年一月二十二日，牟元笛荣获“上海发布·大世界城市舞台中国魅力榜”金奖。二月，他指导歌手霍尊进行戏曲演唱，节目于湖南卫视《歌手 2018》中播出。五月，他随学校出访多米尼加共和国的圣多明哥、圣地亚哥以及阿根廷的布宜诺斯艾利斯、伊瓜苏等地进行交流演出。六月，他参加了中国戏剧家协会举办的首期中青年一线文艺骨干培训班。八月，他担任了上海戏剧学院附属戏曲学校首届中本贯通京剧表演班（18级）的班主任工作。九月二十八日，他在周信芳戏剧空间再度公演了全本《天女散花》。十一月，他录制完成了中国京剧像音像工程《翠屏山》。 二零一九年一月，牟元笛进入电视剧《鬓边不是海棠红》剧组，与尹俊共同担任全剧的戏曲指导。同月，他赴法国巴黎进行了文化艺术交流。六月二十三日，他在上海白玉兰剧场与戴国良首演了《评雪辩踪》。八月二十五日，他在依弘剧场与郝帅合演了《平贵别窑》。十月，他客串拍摄了优酷演技派电影《紫禁城里的小食光》。十月二十一日，他参加了上海第83届国际电工委员会大会的开幕式演出。十二月七日，他在苏州开明大戏院与杨少彭、胡文阁、李宏共同演出了《大登殿》。 二零二零年十月十九日，在上海戏剧学院莲花路校区白宫剧场，牟元笛与戴国良主演了京剧《遗翠花》。二零二一年五月三十日，在上海天蟾逸夫舞台，他与戴国良主演了昆曲《游园惊梦》。十二月二十七日，他在北京梅兰芳大剧院“薪火相传”艺术院校京剧中青年教师挖掘整理传统剧目展演中，演出了京剧《遗翠花》。二零二三年一月二十二日，他参与的《“四海同春”2023全球华侨华人春节大联欢》播出，在其中表演了节目《最忆梨花开》。