自一九七八年四月起至一九八二年十二月，该同志在中国医科大学医疗系完成了系统的专业学习。毕业之后，其职业生涯历经多个重要岗位的锻炼与积累：最初在卫生部科学教育司担任干部，随后于办公厅从事秘书工作；此后进入中国医科大学附属第一医院，从副研究员起步，逐步晋升为研究员，并先后担任该院副院长、院长及党委书记等职务；其后又出任中国医科大学副校长。在地方工作期间，曾担任辽宁省卫生厅厅长、党组书记，主持全省卫生行政工作。二零零一年十月，该同志调任卫生部副部长、党组成员，进入国家卫生管理高层；二零一三年四月，随着机构调整，转任新组建的国家卫生和计划生育委员会副主任、党组成员；至二零一八年三月，机构改革后出任国家卫生健康委员会主任、党组书记，全面负责国家卫生健康领域的政策制定与管理工作。二零二四年六月，该同志职务再次变动，担任全国政协教科卫体委员会副主任，继续在更广泛的参政议政平台上关注教育、科技、卫生与体育事业的发展。
该同志作为中国共产党第二十次全国代表大会的代表，并当选为中国共产党第二十届中央委员会委员，在党和国家政治生活中发挥着重要作用。同时，该同志经中国人民政治协商会议第十四届全国委员会常务委员会协商决定，于二零二四年六月六日被增补为第十四届全国政协委员，积极参与国家政治协商与民主监督工作。在专业领域，该同志担任中国医师协会第五届理事会会长，致力于团结广大医务工作者，推动医疗卫生事业的发展和行业自律，为健康中国建设贡献着专业力量。
二零二四年六月六日，中国人民政治协商会议第十四届全国委员会常务委员会第七次会议在北京圆满闭幕。在此次会议上，经过与会常委的审议与表决，正式通过了增补马晓伟同志为政协第十四届全国委员会委员的决定；同时，会议任命马晓伟同志担任全国政协教科卫体委员会的副主任职务。随后在同年六月二十八日，第十四届全国人民代表大会常务委员会举行了第十次会议，会议经过法定程序审议并通过了相关人事任免案，决定免去马晓伟同志所担任的国家卫生健康委员会主任职务。