其中主要作品有：《十五的月亮》《峨嵋飞盗》《苏小三》《戴手铐的旅客》《海囚》《双雄会》《婚礼》《枪从背后打来》《李四光》《一盘没有下完的棋》《巴陵女侠》《青龙剑》《天涯月正圆》《并非白色》《九妹村的暴风骤雨》等。马树超人物照建国大业（2009年）--王成俊《神枪手与智多星》--校长（2007年王晶编剧、姜国民导演）野蛮秘笈（2006年）王晶导演远山姐弟（1992年）枪访要塞（1991年）枪，从背后打来（1987年）十五的月亮（1986年）峨眉飞盗（1985年）普通人家（1984年）生财有道（1984年）双雄会（上、下集）（1984年）非常岁月（1983年）一盘没有下完的棋（1982年）海囚（上、下集）（1981年）--潘火狮戴手铐的旅客（1980年）-张强《无声世界》（2008年）《敌后别动队》20集（2010年）（别名：狼口边上的孩子、抗日英雄之鬼见愁）边导边演《敌后英雄》（2011年原名：冀中锄奸队），边导边演《敌后武工队》（1999年出演武工队队长魏强，边导边演）《 回民支队马本斋》1993年（又名：抗日英雄传）《99只小白鸽》3集（1993年主要演员：钮 言 、马树超、李蕴杰）濮阳中原电视台摄制，获第三届（1993年）中宣部五个一工程奖，同年8月获得全国第三届银屏奖儿童剧一等奖。《少年毛泽东》（1991年）《敌后英雄》（2011年原名：冀中锄奸队），边导边演《敌后别动队》20集（2010年）（别名：狼口边上的孩子、抗日英雄之鬼见愁）边《敌后武工队》（1999年出演武工队队长魏强，边导边演）《爱情AA制》（2007年）导演补天 (2002年) .... 导演远山姐弟(1992年) .... 导演少年毛泽东（1991年）导演: 马树超陈力枪访要塞(1991年) .... 动作枪，从背后打来(1987年) .... 动作峨眉飞盗(1985年) .... 动作
作为中国影坛“第五代电影人”的代表之一，马树超在导演领域取得了令人瞩目的成就。由其执导的电影《远山姐弟》在1993年接连荣获了当年的电影“政府奖”以及“五个一工程奖”，同时还摘得了第五届“童年奖”的桂冠。到了1994年，这部作品更是在国际舞台上大放异彩，成功斩获了第三十一届国际亚广联大奖中的“京都奖”，赢得了广泛的国际认可。不仅如此，马树超在电视剧领域同样才华出众，他同时担任导演并亲自主演的电视连续剧《马本斋》在1994年也获得了极高的评价，一举夺得了该年度中国电视剧“飞天奖”的一等奖，并再次入选年度的“五个一工程奖”，充分展现了其跨越电影与电视两个领域的卓越艺术造诣与创作实力。