一九四五年，卢碧云在中华电影联合股份有限公司参与演出，并主演了《现代夫妻》与《人海双珠》等多部影片。同年，由于父亲对演艺事业的反对，她做出了第一次退出演艺圈的决定。次年，她与国民党将领黄飞达结婚，但婚后不久便选择重返影坛。抗日战争胜利之后，她相继加入文华、益华等影业公司，并因主演《母与子》及《马路英雄》等作品而在上海引起广泛轰动。一九四九年，卢碧云随同丈夫移居台湾，定居于新竹。在此期间，她曾担任农业教育电影公司的演员，并出演了间谍题材影片《恶梦初醒》。由于接连饰演了《罂粟花》、《八十八号情报员》等同为宣教性质的间谍片，她的银幕形象一度似乎被定型于女间谍这类角色之中。婚后，卢碧云将生活重心更多地转向家庭，曾在完成《天伦泪》的拍摄后再次选择息影。直至一九六四年，她才重新复出，但此后只接演与自身年龄相称的角色，从而在台湾逐渐树立起温婉贤淑的良母贤妻形象。一九六五年，她凭借在影片《烟雨濛濛》中成功塑造的“雪姨”一角，荣获台湾第四届金马奖最佳女配角奖。一九六九年，她加入当时刚刚成立的台湾中国电视公司，迎来了个人演艺生涯中最为忙碌的阶段。尽管多数时候饰演的是母亲或祖母等配角，但她的戏路却因此得到了明显的拓宽。此后，她陆续在《烟雨》、《烟水寒》、《半山飘雨半山晴》、《我心深处》、《我是一片云》、《碧血黄花》等影片中担任主角或出演重要角色。一九九三年，卢碧云荣获第三十届金马奖纪念奖，以表彰其长期对影坛的贡献。