林宝军同志于一九六三年二月在吉林省松原市出生。自一九七九年九月至一九八三年六月，他在吉林工业大学完成了本科阶段的学习，并顺利获得工学学士学位。随后，他继续在该校深造，于一九八四年九月至一九八七年九月期间攻读硕士学位，成功取得工学硕士学位。紧接着，林宝军同志又于一九八七年九月至一九九一年六月在吉林工业大学进一步攻读博士学位，最终荣获工学博士学位。在其职业生涯中，他曾担任我国载人航天工程空间应用系统的副总设计师，为相关领域的技术发展作出了重要贡献。二零一八年十一月，林宝军同志被任命为中国科学院微小卫星创新研究院副院长，主持并参与了多项科研与管理工作。至二零二三年二月十七日，经中共中国科学院党组认真研究后作出决定，免去林宝军同志在中国科学院微小卫星创新研究院的副院长职务，同时其副局级待遇予以保留。
长期致力于计算机控制与应用、空间技术、卫星总体设计以及空间应用系统总体等多个专业领域的研究与工程实践。在担任导航卫星总设计师期间，成功组织并完成了中国首颗新一代北斗导航卫星的全面研制任务，保障了该卫星的顺利发射与在轨长期稳定运行。作为主管副总设计师，先后主持完成了神舟二号与神舟五号飞船应用系统船载设备的研制、系统级电性能综合测试、整船总装测试、发射场总装测试发射以及全程飞行试验等一系列关键工作，确保了两次任务均取得圆满成功。同时，还主持完成了神舟三号、四号、六号及七号飞船应用系统在轨飞行控制任务，实现了各次飞行的预定科学与应用目标。 在科研项目方面，主持完成了国家自然科学基金项目“球载空间望远镜姿态指向智能控制系统”的研究工作；负责并完成了天文卫星###BOOKTITLE_1###预研项目中卫星工程系统的预先研究任务；负责并完成了神舟二号飞船中X射线探测器数据采集及管理系统的研制工作。在系统仿真与设计能力建设上，建立了飞行器运控模式仿真系统，并基于该系统完成了从神舟二号至五号任务的运控方案及飞行程序设计；此外，还牵头筹建了总体设计仿真实验室，为后续任务提供了重要支撑。 在飞船应用系统总体工作中，主持并深入开展了系统总体技术方案的论证、设计与优化，组织并实施了四艘飞船的桌面联试，协调处理了大量内外技术接口问题，研究并制定了相关接口规范，对系统在轨运行模式进行了深入研究，并负责了各项大型试验的准备、组织及相关技术方案的制定。作为项目负责人，主持开展了院所级重大项目“小卫星及关键技术研究”的实施方案与项目可行性论证工作；参与了“小型月球探测器系统总体技术”项目，负责完成了月球轨道卫星的总体方案及各主要分系统的方案设计。此外，还参与了“空间实验室大系统论证”工作，并作为主要执笔人编写了大系统论证报告；同时也参加了双星探测计划等相关论证工作。 在人才培养方面，近年来累计培养博士研究生21名，其中已顺利毕业13名；培养硕士研究生34名，其中已毕业29名，为相关领域输送了一批高层次专业人才。
于2004年3月，因其在中国载人航天工程中的卓越贡献，荣获中国科学院颁发的载人航天工程突出贡献者荣誉称号。其所参与的“中国载人航天工程”项目，荣获国家科学技术进步奖特等奖，其个人在该奖项中排名第五。此外，还获得部委级科技进步一等奖一项（作为第二完成人），以及上海市发明一等奖（排名第一）。在省部级科技奖励方面，共获得科技进步一等奖与二等奖共计六项。2017年，先后荣获全国首届创新争先奖状与中国科学院杰出成就奖两项重要荣誉，并取得北京市科学技术奖二等奖一项。基于其长期的科研成就与影响力，成功入选国家“百千万人才工程”。同年5月，再度获得全国创新争先奖，进一步彰显了其在科技创新领域的领先地位与持续贡献。
林老师在不同求学阶段所选择的专业领域跨度相当广泛，他本科阶段主攻内燃机工程，随后在硕士阶段转向了计算机科学，而博士期间又深入钻研了软件控制理论。在完成博士学位后，他进一步从事博士后研究，其方向是高能天体物理学。这种跨越多个重要学科的教育背景，使得他在不同知识领域都具备了扎实的学术基础，因而在同事们眼中，他几乎可以被视为一部行走的百科全书。