自一九七五年十二月至一九七七年三月，该同志在安徽省泗县城南公社参与插队落户，投身基层实践。随后于一九七七年三月至一九八二年一月期间，进入淮南矿业学院物理师资班，系统学习物理专业课程，完成了本科学业。毕业后，自一九八二年一月至一九八四年九月，在山东矿业学院基础课部担任教师，开始了其教学生涯。为进一步提升专业素养，于一九八四年九月至一九八六年一月，进入复旦大学理论物理助教进修班深造。进修结束后，自一九八六年一月至一九九一年九月，返回山东矿业学院基础课部继续从事教学工作。 在积累了多年教学经验后，该同志于一九九一年九月至一九九四年九月，进入山东矿业学院矿建系控制爆破专业攻读硕士研究生，并获得硕士学位。学成后，自一九九四年九月至一九九七年七月，再次回到山东矿业学院基础课部任教。自一九九七年七月起，开始承担更多管理职责，担任山东矿业学院基础课部副主任，直至二零零零年三月。随后，在二零零零年三月至二零零一年一月期间，出任山东科技大学基础课部主任。 进入新世纪后，其职务进一步调整，于二零零一年一月至二零零二年一月，担任山东科技大学教务处处长。自二零零二年一月至二零零三年十月，晋升为山东科技大学党委常委、副校长，参与学校高层管理工作。二零零三年十月至二零零七年一月，调任至山东省教育厅，担任副厅长、党组成员，投身于更广泛的教育行政工作。 二零零七年一月至二零一零年八月，该同志出任山东财政学院院长、党委副书记，主持学院全面工作。二零一零年八月至二零一八年四月，担任山东省委高校工委副书记（正厅级），负责全省高校党建与思想政治工作。最后，在二零一八年四月至二零一九年十月期间，担任山东省委教育工委副书记、省教育厅副厅长（正厅级）、党组副书记，继续为山东省教育事业的发展贡献力量。
2022年10月27日，当选山东省学前教育学会会长
二零一八年五月，山东省人民政府正式发布人事任命通知，决定任命黄琦同志担任山东省教育厅副厅长一职，并明确其职级为正厅级。此次任命体现了省政府对其工作能力与专业素养的充分认可。随后在二零一九年十月，山东省人民政府根据工作需要和干部调整安排，经过相应程序研究决定，免去黄琦同志所担任的山东省教育厅副厅长职务。这一人事变动属于政府部门正常职责调整与人事更迭的范畴。