宫崎吾朗在三岁那年随家人一同迁居至所泽市，并在这座城市度过了他完整的童年时光。青年阶段，他进入琦玉县所泽高校学习，出于对山林自然的热爱，在校期间他主动加入了学校的登山社团。此后，他考入信州大学，并选择了与山林环境密切相关的农学部森林工学系（该系后来更名为森林科学科），继续深化自己在自然与森林领域的专业知识。大学毕业后，宫崎吾朗进入一家名为“森绿地设计事务所”（株式会社森绿地设计事务所）的景观设计顾问公司工作，在职期间他主要负责多项涉及城市公园规划与都市绿化建设的项目，还曾亲自设计并规划了其父亲宫崎骏所使用的吉卜力工作室的顶楼景观与摆设造型。由于宫崎骏当时正计划建造一座具有鲜明吉卜力风格的主题美术馆，吉卜力的资深动画制作人铃木敏夫便邀请宫崎吾朗协助完成美术馆的设计工作。为此，宫崎吾朗离开了原先任职的设计事务所，并于1998年正式加入吉卜力工作室。2001年，随着吉卜力美术馆顺利落成，宫崎吾朗被任命为该美术馆的首任馆长，同时兼任美术馆旗下事业部门“曼马由特队”（マンマユート団）的社长职务。2003年，宫崎吾朗应铃木敏夫的邀请，参与了动画电影《地海战记》的筹备小组工作。随后，铃木敏夫决定由吾朗担任这部影片的导演，为了全心投入动画执导工作，宫崎吾朗决定辞去吉卜力美术馆馆长的职务。该片最终于2006年夏季正式公开上映。2008年，宫崎吾朗尝试策划将父亲宫崎骏所欣赏的作家堀田善卫的著作《方丈记私记》改编成动画，这项策划案后来在神奈川近代文学馆举办的“堀田善衞展 スタジオジブリが描く乱世”展览中公开展出。2011年7月，他正式发表了个人执导的第二部动画作品《来自虞美人之坡》。值得一提的是，“曼马由特队”（マンマユート団）这一名称来源于吉卜力1992年推出的动画电影《红猪》中登场的空贼集团，同时它也是三鹰市立动画美术馆的实际运营事务会社。该部门最初注册为“株式会社Muzeo・Dalte・Ghibli”（株式会社ムゼオ・ダルテ・ジブリ），后于2001年10月1日正式更名为“株式会社マンマユート団”。
宫崎吾朗于1967年1月在日本东京都出生。2001年10月，他出任三鹰市立动画美术馆的首任馆长，这一职务他一直担任到2005年。同年同月，他还开始担任マンマユート団（MAMMA AIUTO）的社长，负责该公司的运营管理，直至2005年。2005年3月，宫崎吾朗凭借其在艺术领域的杰出贡献，荣获了日本芸术选奨新人赏（艺术选新人奖），这一奖项肯定了他在艺术创作上的潜力与成就。 2006年7月，宫崎吾朗自编自导的奇幻冒险动画片《地海传说》在日本正式上映，这部作品标志着他作为动画导演的首次重要亮相。2008年10月，由他参与策划的展览「堀田善衞展 スタジオジブリが描く乱世。」向公众开放，展览内容深刻反映了吉卜力工作室对历史动荡时期的艺术描绘。2011年7月，宫崎吾朗再次担任导演，推出了作品《虞美人盛开的山坡》，进一步展现了他独特的叙事风格和导演才华。 2019年7月，宫崎吾朗与他的父亲、著名动画大师宫崎骏联合执导了一部动画短片《吉卜力工作室完整特别短片合辑1992-2016》，这次合作融合了两代人的创作理念，成为动画界的一段佳话。2020年6月3日，日本NHK电视台正式宣布，吉卜力工作室的全新长篇动画作品《阿雅与魔女》将于当年冬季在NHK电视台播出。该作品由宫崎骏亲自负责企划，并由其长子宫崎吾朗担任导演，采用先进的3DCG技术制作，是一部备受期待的长片电影。此外，宫崎吾朗的日常生活照片也时常出现在公众视野中，让观众得以一窥这位动画导演工作之外的亲切面貌。