芳根京子的演艺生涯始于2013年,当时她加入了由同事务所前辈筱原凉子主演的爱情剧《最后的灰姑娘》,在剧中饰演女主角闺蜜的女儿“武内咲”,由此正式以演员身份踏入演艺界;同年10月,她进一步在优香主演的深夜剧《白马王子 纯爱适龄期》中亮相,扮演了女学生“北凉子”一角。进入2014年,芳根京子在8月参与了吉高由里子主演的NHK晨间剧《花子与安妮》,饰演女主角花子的挚友“宫本莲子”(由仲间由纪惠饰演)的女儿“宫本富士子”;随后在9月,她迎来了个人演艺生涯的一个重要里程碑,首次担任主演的电影处女作《物置のピアノ》在日本全国影院上映。2015年对芳根京子而言是收获颇丰的一年,她在6月从超过一千名的竞争者中成功胜出,获得了主演TBS电视台金十档校园剧《表参道高中合唱部!》的宝贵机会;同年,她更凭借在该剧中的出色表现,一举斩获第86届日剧学院赏的最佳女主角奖以及第1届电视剧信心奖的最佳新人奖;此外,在8月22日,她参演的另一部电影作品《向日葵之丘·1983年夏》也如期上映。同年10月,她与志尊淳合作,共同主演了改编自漫画的爱情电影《前辈和她》,该片在日本上映后获得了关注。 2016年3月,芳根京子加盟了由有村架纯主演的月九档爱情剧《追忆潸然》;紧接着,她在富士电视台于夏季档期播出的SP特别剧《蒙太奇 三亿元事件奇谭》中担纲女主角,展现了其独挑大梁的能力;同年4月,经过第四次参与NHK晨间剧女主角的选拔,她最终脱颖而出,成功获得了主演第95部晨间剧《别嫔小姐》的珍贵机会。2017年,芳根京子继续活跃于大小屏幕,她出演的TBS日九档刑侦剧《小小的巨人》于6月16日播出;随后在7月22日,她与中岛健人联袂出演的青春群像电影《心灵想要大声呼喊》上映,在片中她挑战了饰演一位言语被封印的女高中生“成濑顺”。2018年伊始,她主演的富士台月九剧《海月姬》于1月15日开播;6月28日,她参演了由冢本连平导演执导的新片《今天也是招人嫌的便当》;同年9月7日,她出演了由佐藤祐市执导的电影《深红累之渊》,在片中饰演一位拥有精湛演技却因相貌丑陋而困扰的女演员渊累,这一角色颇具深度;9月28日,由西岛秀俊主演的电影《椿花散落》在日本上映,芳根京子也在其中有着重要演出。 2019年3月,为纪念北海道电视台(HTB)成立50周年而制作的台庆剧《请勿转台》播出,芳根京子在剧中担任主演;同月,她凭借在作品《深红累之渊》和《椿花散落》中的卓越表现,荣获了第42届日本电影学院奖的最佳新人奖,这是对其电影演技的高度认可。5月17日,她参演的电影《打瞌睡的磐音》上映。同年7月,她出演的富士台火九剧《两周》也如期与观众见面。2020年,芳根京子依然保持着高产,她出演的电影《记忆使者》于1月17日上映;1月20日,她参演的由古馆宽治和泷藤贤一共同主演的电视剧《古泷兄弟与四苦八苦》播出;10月9日,她出演的由仲野太贺主演的电视剧《我梦见了那个女孩》开播;此外,在同年10月及2021年1月,她参演的剧集《真凶FLAG》分为上下两部相继播出。 2021年,芳根京子的作品持续亮相,她出演的电视剧《Byplayers 3:名配角的森林100日》于1月8日播出,紧接着在1月17日,另一部她参演的电视剧《你与世界终结的日子》也与观众见面。2月11日,她出演的电影《初恋》登陆影院。4月9日,其参演的电影《Byplayers:如果100名配角一起拍电影》上映;4月17日,电视剧《短剧开始啦》播出;4月30日,电视剧《半径5米》开播。到了下半年10月10日,她出演的电视剧《真凶标签》也如期播出。2022年,芳根京子继续拓展其演艺版图,参演了电视剧《我的可爱要过期了!?》。6月17日,她出演的电影《峠:最后的武士》上映。同年7月,她参演了电视剧《老菜鸟》,并同时参与了另一部剧集《老将新生》的演出。2023年2月,她加入了水十剧《这不是抄袭吗?》的演出阵容;7月27日,她出演了作品《彩虹色粉笔 与智障人士一起走过的町工厂奇迹》。进入2024年,芳根京子主演的日本电视台开局70周年纪念剧集《电视记者》于3月5日播出;4月11日,她参演的富士台4月木十剧《Re:复仇-欲望的尽头-》正式开播;10月20日,她参演的电视剧《月刊 松坂桃李》也与观众见面。 展望2025年,芳根京子的行程依然密集,她参演的电影《要是晴天就好了》将于1月10日播出;1月12日,另一部她参演的电影《去唱卡拉OK吧!》在日本上映;1月14日,她主演的电视剧《小圆26岁、在做实习医生!》将播出。1月24日,她参演的电影《雪之花》上映,在片中她饰演良策的妻子笠原千穗;4月24日,她参演的电视剧《波光和煦,夫妻良辰》播出。年末,她出演的电影《无法在你面前哭泣》将于11月14日上映,而她参演的电视剧《25年的恋 ~另一位芳根京子,前往罗马~》则定于12月14日播出。
2022年1月24日,芳根京子宣布确诊新冠肺炎。
日本主流媒体对芳根京子的天然美貌给予了高度评价,她拥有一双明亮的大眼睛和线条优美的翘挺鼻梁,被誉为典型的清新美少女。与她首次合作的演员福士苍汰也对她的表现赞赏有加,他特别提到,尽管在2016年拍摄时芳根京子年仅十八岁,但她的外貌气质显得更为青春灵动。尤其令人印象深刻的是,只要一进入拍摄状态,面对摄影机的芳根京子就能迅速展现出自然而扎实的演技,其专注程度与表演稳定性都显示出她作为一名年轻演员的优秀潜质,堪称是一位集中力极高、颇具发展前景的女演员。